动植物基因组重测序技术介绍
***************************************************************************************************** 技术简介: 全基因组重测序就是对基因组序列已知的物种或个体进行基因组测序,从而对群体或者个体在全基因组水平进行差异性分析,通过与参考基因组进行比对,发现大量的基因序列变异和结构变异,例如单核苷酸多态性位点(SNP),插入缺失(InDel),拷贝数变异(CNV),结构变异(SV)。因此动植物基因组重测序在群体进化,功能基因鉴定,分子标记开发,动植物育种,疾病研究等方面具有非常重要的指导意义。 应用领域:
技术优势:
技术参数与实验流程
***************************************************************************************************** 技术参数
A. 建库测序流程
B. 数据分析流程
图一:62个枣椰树品种单核苷酸多态性分析
(动植物重测序.pdf第二页 figure 1)
图二:枣椰树群体结构分析。(A)主成分PCA分析。(B)Neighbour-joining tree(c)群体分层
(动植物重测序.pdf第三页 figure2)
图三:枣椰树基因组中近亲繁殖的证据
(动植物重测序.pdf第四页 figure3) 动植物基因组重测序技术介绍 ***************************************************************************************************** 技术简介 全基因组重测序就是对基因组序列已知的物种或个体进行基因组测序,从而对群体或者个体在全基因组水平进行差异性分析,通过与参考基因组进行比对,发现大量的基因序列变异和结构变异,例如单核苷酸多态性位点(SNP),插入缺失(InDel),拷贝数变异(CNV),结构变异(SV)。因此动植物基因组重测序在群体进化,功能基因鉴定,分子标记开发,动植物育种,疾病研究等方面具有非常重要的指导意义。 应用领域
技术优势
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